这几天小智一直在为关东联盟石英大会，和宝可梦们做着各种特训，没有参加任何的娱乐活动。不过听了小霞、小刚说了不少事，像是跟随花子前往比努旅行的时候大木博士拜托他们请教在比努的西野森教授呆呆兽和大舌贝进化成呆壳兽（呆河马）这个问题，于是就去了趟西野森教授的研究所。
西野森教授他有点古怪，而且比较马虎。博士喜欢别人称呼他为西野森五世而不是西野森教授，小刚认为他的古怪性格是所有搞研究的共通病，在他慌张时会向挂在研究所墙的西野森一世、二世、三世和四世自说自话，有时还会不小心连自己的照片也对着自说自话。他在墙挂的自己的照片比本人更帅。
西野森教授也正在被呆呆兽如何进化成呆壳兽而烦恼，因为大木博士也弄不清楚这个问题。西野森教授想要钻研透这个问题，然后写成论文在学术界发表。
西野森教授通过钓鱼来研究呆呆兽生态的一部分，这时小霞发现了自己的可达鸭的呆呆的表情和呆壳兽很像，两只宝可梦开始了发呆大战。西野森五世提议先吃午饭，再做研究。
用餐后，西野森教授用笔记本电脑向他们展示两扇类的大舌贝咬呆呆兽的尾巴，让呆呆兽进化成呆壳兽后，大舌贝就会变成螺贝类，这被西野森五世称为是“宝可梦七大不可思议之一”，他想要解开这个谜题从而得到大家的敬重。
突然火箭队三人组袭来想要拜托西野森教授制作火箭队的图鉴。西野森五世最初对会说话的喵喵很感兴趣，但他发现他们是来绑架自己的就慌乱了手脚，而火箭队的目的是夺走西野森五世的宝可梦。得知教授只有呆呆兽的火箭队，决定用大舌贝让呆呆兽进化再收服过来，西野森五世立刻带着呆呆兽逃跑，在小霞的可达鸭的帮助下，攻击了火箭队。大舌贝咬住了呆呆兽的尾巴进化成了呆壳兽打飞了火箭队。
西野森五世终于解开了呆呆兽进化的谜团，他认为呆呆兽和大舌贝是共生关系，并决定在宝可梦学会发表。
最后，离开时，呆壳兽与小霞的可达鸭告别，却陷入了无尽的发呆中。
小智一次来到比奴市慢跑时，听说“大星期二”将要来临，所以来了很多来挑战的冲浪手。
“大星期二”是二十年一次来到比奴市的大海浪，每二十年都会引来许多从各地前来挑战的冲浪手。只要把旗子插到海最高的岩石的顶部就可以创造奇迹，像“传说中的冲浪手阿将”那样。
阿将是四十年前的冲浪手，他被称为传说的冲浪手。他第一个成功挑战大星期二，并且将他的旗子插在海岩石的顶部。
小智想试试冲浪，他对自己的运动神经很有自信，但是摔了好几次。小智掉到水里几次后，开始一动不动的躺在水里仰望天空想为什么会失败。
“你是不是在想为什么失败？那是因为你心没放在面。”原来是一个绑头发，留着小胡子的中年男子，而且他还带着一只“皮卡丘”，看样子他也是一名冲浪手。
“请问您是？”小智爬回自己的冲浪板，很有礼貌的问道。
“我的名字叫敏川特，这是我的皮卡丘，马奎尔。”敏川特介绍了他和他的皮卡丘，马奎尔。
“皮卡丘~”
小智想了想，“是啊，最近发生了不少事啊，所以老是心不在焉的。”
敏川特带小智等人来到了他的租所讲述了自己当年的事：四十年前，敏川特因为崇拜传奇冲浪手阿将而开始学习冲浪。随后他和阿将认识。阿将在挑战大星期二成功后，说了“下一次就换你了。”将自己的冲浪板交给敏川特，鼓励敏川特继续努力，然后向着遥远的海洋旅行去了。二十年前还是青年的敏川特挑战大星期二失败，沮丧中他想放弃冲浪，这时遇到了乘着一块漂流木从海来一只皮卡丘，那就是马奎尔，这使他再次重新燃起斗志，从此他们一起生活和训练至今。
马奎尔是一只不可思议的皮卡丘，它有着可以用身体来感觉海浪的能力。马奎尔有一种感觉大海浪接近的能力，而且还能够预测海浪的动向。特别是那标志性的海蓝色的眼睛更使它看起来不是一只普通的皮卡丘。
马奎尔总是坐在一个悬崖边，试着感知大海浪。
小智的皮卡丘和马奎尔玩的时候火箭队突然出现抓走了他们，结果碰了来浅滩产卵的暴鲤龙，被破坏光线轰飞。坐船赶来的小智等人和敏川特也成功救到了皮卡丘和马奎尔。这时，大星期二终于来了，敏川特要和马奎尔一起征服大星期二，小智等人只好回到岸边的车道。
敏川特拿出了一面绿色的旗子和马奎尔一起插在了最高的海岩石（就在阿将的红色旗子旁边）成功征服了大星期二。创造了新的传说，“踏浪（冲浪）皮卡丘的传说”。
敏川特走到了两个小孩说道：“下一次就换你了。”和阿将一样他将这句话和意志传给了下一代新人。
听说有人在米亚查山看到了“四大天王中格斗系的希巴”，在小刚的劝说下小智想去山特训也不错于是来到了米亚查山。
米亚查山的水土对大岩蛇来说非常好，所以米亚查山的大岩蛇都长得很大，被称为巨大大岩蛇的产地。
在山中，小智一行人在爬山时遇到了一只脸部右侧有十字刀疤的巨大大岩蛇袭击，就在危急时刻被一个人救下那个人就是希巴。小刚想请教让宝可梦训练家变的更强的“大秘技”。希巴听小刚说什么都愿意做，之后希巴分别让小智、小刚两人提水、劈柴、搬石头，小智开始有点后悔来找希巴，想他肯定只是想为吃饭找的借口，小刚不信——果然希巴像小智说的只是想吃饭所找的借口（只是教了他们野外求生的“大秘技”）。小霞认为他不过如此，有许多的防备破绽。小刚反驳道尽管希巴看似有许多破绽，其实他早有防备并拿起树枝向他攻击，事实希巴的确像小霞所说的毫无防备。在希巴醒来之后，小刚继续询问宝可梦训练家的“大秘技”到底是什么时，希巴告诉他们根本没有所谓的大秘技，他来到米亚查山是为了收服最大的巨大大岩蛇（就是之前那只脸部右侧有十字刀疤的巨大大岩蛇）。还说，“身为训练家就是要收服最厉害的宝可梦才行。”
小刚抱头大叫：“我心中的希巴大师的形象崩溃掉了——”
小智拍拍小刚的肩膀，“人不可貌相嘛……”
小智想在山特训一段时间，于是一行人就暂时留在山修行。突然远处传来一条大岩蛇的大叫，过去一看——看到希巴在和之前的那只脸部右侧有十字刀疤的巨大大岩蛇交手，但希巴并没有用任何宝可梦。希巴看起来和刚才判若两人，他凭借自己的轻功水平即使不用宝可梦也能击败它，一直在和失控的巨大大岩蛇勾通。终于巨大大岩蛇停了下来——希巴帮巨大大岩蛇从身体内取出了一只穿山王，原来是因为穿山王不小心钻进这只巨大大岩蛇的身体里才使得它如此狂躁不安，希巴问它是否愿意跟随他，巨大大岩蛇表示愿意，就这样希巴收服了大岩蛇。
小刚看到这一幕立刻前询问希巴“大秘技”。希巴还是说，“没有什么大秘技”。可小智却向希巴行了个礼，“谢谢，大师指点。”
“这是怎么回事啊，小智？”小刚问道。
希巴点了下头，“看来你已经明白了，如果有大秘技那应该是‘宝可梦和人类心灵的相通’。”希巴离开时对小智说道：“你的事我已经在渡那里听说了。”
“额！？”
希巴严肃的说道：“现在的你应该把心思放在石英大会，坂木的事就交给我们吧，专心修练，期待将来有一天能够跟你交手，再见了！”希巴说完便跳出山崖离开了。
“多谢，大师教诲。”小智受到了希巴的教诲明白了，现在不是思考如何打倒坂木，而是在石英大会获得优胜，连这一点都办不到的话更别说坂木了。
听了希巴的教诲，小智回到家后，训练变得比之前更加认真，不久石英大会就要开始了，小智收拾好行囊出发了。
小智一行人在前往石英高原的路遇到了一个戴头巾的训练家向小智发出挑战。却被小智和皮卡丘轻松解决。他们没有注意到有一双眼睛正在看着他们，突然飞来一只快龙递给他一张信封。打开一看原来是一张立体影像数据卡，然后就出现了一个像修女的女子的影像像贵妇一样，用手捏着裙子。微微鞠躬，说道：“非常冒昧发这封信给您，请见谅。由于你们是、前途最被看好的训练家，所以邀请你们来参加我们主人、最强的宝可梦训练家的宴会。”人影消失，出现了一幅去新岛的地图，“地点是新岛——宝可梦城，请你们填妥回信用的明信片，决定来或是不来。这是最强的，宝可梦训练家的邀请，请务必接受。”鞠了个躬后影像消失了。
“小智，要怎么办？”小霞问道。
“参加呀！我们应该参加。”小刚早就被刚才的美丽小姐吸引住了。
小智思考了一会儿，“参加吧，反正大赛后天才开始，还有时间。”决定参加，小智在明信片的Yes打了勾，他也不知为什么，“去了会有不祥的预感，但不去又有种不得不去的感觉”。