回到了故乡真新镇的小智今天起了个大早没有吵醒皮卡丘，开始做早餐，不久花子和魔墙人偶也一起帮忙做早餐。
昨天小霞和花子一起睡，小刚睡在客厅的沙发（这就是小智为次的事的复仇）。
“小智今天你是要去大木博士那里把？”花子突然开口。
“是啊。”
“那你回家能打扫一下卫生吗？妈妈今天要和小魔出去买东西。”
“可以。”
“小智你是不是发生了什么事？这几天你看起来好像不太高兴？”花子有点担心的问道。
小智停下了动作，“是发生了点事……”
花子也不勉强小智告诉她发生了什么事。
做完早餐小刚也醒了过来，花子去叫小霞起床，小智也跑去叫醒皮卡丘。小刚有点失望，因为他也想帮忙做早餐，没想到被遗忘了。
吃完早餐小智带着小霞、小刚去大木研究所。
“大木博士，我是小智。”
“啊你终于来了，我好想见你啊，波克比。”大木博士来就无视了小智的招呼。
“哎……算了。”小智耸了耸肩膀。
“嘿，小智！”小蓝向小智挥手，小茂一声不吭在喝茶。
“哦，小蓝啊。”小智自然而然的坐到大木博士客厅的沙发。
“什么态度嘛？”小蓝的嘴鼓了一下，这次向小霞挥手：“嘿，小霞。”
“嘿，小蓝。”小霞坐到小蓝旁边，她们两个早就是一对闺蜜了。
大木博士向小智一行人和小茂、小蓝介绍了宝可梦研究所的工作，不过对小智来说已经是非常熟悉的事了，因为小智经常来帮忙，有时还会带着球队一起来帮忙。
宝可梦研究所的工作：从替宝可梦做健康检查开始，首先把精灵球里的宝可梦放到庭院去，当然都准备好了适合它们的环境（范围非常大）。接下来是喂食宝可梦，因为宝可梦的种类很多，要准备每一个宝可梦吃的食物（那是很辛苦的），光做这几件事就要花掉一午的时间。然后从下午开始做研究，决定好主题以后再做各种研究。每天为它们饲料“培养感情”，这也是建立良好关系的一环。考虑到要让宝可梦们自然生活，尽量让它们在被收服以前的环境之中，在调查个体差异面这一点是很重要的。
在大木研究所的庭院参观的时候小智突然想起之前“天青山的事”，便和大木博士说起。大木博士听了小智在天青山时发生的事感到震惊，没想到小智和克罗斯竟然遭遇了那么大的事。大家也对小智的经历的事感到震惊，这让小茂有点不服气，没想到小智竟然会得到“虹色之羽遇到影子中的引导者玛夏多，成为彩虹勇士，挑战凤王”。
大木博士拍了下自己的脑袋，“竟然一直忘了告诉小智虹色之羽的事（还有他认识梵爷的事）”。难道是因为工作太忙了，还是自己老了。
从那里大木博士询问到了宝可梦联盟比赛的地点和日程，真新镇的三位训练家互相道别去做各自的特训。小智帮大木博士处理了一些事后回到家，小智想在打扫卫生前先介绍一下自己的家里（昨天没介绍的房间）。
首先是从客厅、厨房、厕所到介绍花子的房间，还有小智的房间：小智的房间里桌子有一台笔记本电脑、地球仪和以前球队的照片；橱柜有一台收音机，一台电视机和一颗足球；地有卡比兽抱枕、高低床以及书架。
书架里满是宝可梦知识的书籍，还有其它的书：里面有机械方面的书籍和其它的教科书，不过心思细腻的小刚发现了一些意外收获，那就是“福尔摩斯的书”。
小刚惊讶的说道：“小智没想到你竟然会有‘福尔摩斯的书’，而且还收集了全部。”
“嗯，那是我最喜欢的。”其实小智在以前的世界就很喜欢侦探推理，来到这个世界的时候最想不到的就是这个世界除了没有普通的动物和地区以外其它的东西竟然和之前的世界大致一样。
在“精灵宝可梦XY第14话”中莎莉娜提到了现实世界的的人物德古拉。平行世界什么都有可能发生，所以就算在精灵宝可梦福尔摩斯是真实存在人也不奇怪。
“好了，我要开始打扫卫生了。能请你们到院子里等吗？”小智觉得也差不多该打扫了。
“要不，我们也来帮你把。”小刚自然想帮忙。
“不用，你们是客人，去外面散散步吧。”
“那好吧。”小霞答应了小智。
“对了，千万不要去‘地下仓库’。”小智严肃的顶住了小霞、小刚。
“知道了~”于是小霞和小刚来到了小智家的院子。
在院子里的小霞和小刚四处转悠不知不觉来到了小智说的地下仓库，“这里就是小智所说的地下仓库。”
“有一块牌子！”牌子面写着：非相关人员，特别是对自己的体能没自信的人，除了想提升体能进行训练的人以外，“禁止进入”。
“不进去就不进去。”想起小智的话觉得还是不进去的好。
“进去了会怎么样呢？”不进去又有点好奇，进去了会怎么样。
“奇怪，波克比呢！”小霞突然发现怀中的波克比不见了。
“在哪里！”调皮的波克比打开了地下仓库，的大门进去了里面。
“波克比，不能进去！”于是想都没想小霞就跟了进去，小刚也跟着进去了。
“波克比，波克比，波克比你在哪里！？”在昏暗的走廊沿着向下的台阶，小霞和小刚寻找着波克比。不知走了多久终于有了一丝灯光，两人不知不觉来到了最底下，有一个操作台和一个很大的房间。小霞跟小刚走了进去。
“……（波克比的叫声）”后面传来了波克比的声音。
小霞和小刚回头一看，波克比爬到了操作台（可能因为之前太黑没看见）。
“波克比！”小霞刚想去抱住波克比，没想到波克比跳了一下正好按下了操作台最醒目的按钮。
“蹦！！”巨大的门落了下来把小霞和小刚困在了里面。
“怎么回事？”
“快开门啊！”
急的对着门又敲又打，房间里的灯一下全都打开了。小霞和小刚看向房间里面，有一大堆乱七八糟不知道是什么的机器机关。还没来得急反应地板一斜——他们掉到了那些机器。
首先是一个飞快旋转的大转盘，面还有一根条子往反方向旋转，让他们不得不跑起来。（这是要训练耐力）
“这些是什么呀！？”
“好像是某种训练装置！”
两人狂奔的同时，波克比以为他们在里面玩，在门外开心的笑了起来。小智和皮卡丘一起打扫卫生的时候，小智突然停了下来，“皮卡丘，我怎么觉得，好像出了什么事？”
“皮卡~？”
地下仓库，小霞和小刚好不容易逃过了大转盘，却又掉到了一个新装置。这次是一条粗壮的绳子，绳子不停旋转。这需要站在绳子随时保持身体的平衡。小霞和小刚抱着绳子，怕掉下去摔死。
小霞和小刚通过了一关又一关，爬喷水下来的墙、闪躲激光枪的射击一边跳木马、在移动齿轮等等，让他们连休息和掏出精灵球的机会也没有。
“呜~终于打扫好了。”小智擦了下额头的汗做了个深呼吸，“最后还剩下地下仓库没打扫，皮卡丘，我们走吧。”小智想最后打扫地下仓库。
“皮卡丘~！”（好）
于是小智带着皮卡丘来到了地下仓库，发现地下仓库的门是开着的，小智意识到不对立刻冲了进去，看到波克比在操作台旁边训练室的大门关了没有看到小刚、小霞。小智立刻敲门大喊：“小刚！小霞！你们在里面吗？！”
“小智！快点救救我们！”听到小智的声音小刚、小霞自然是呼救。
小智看了看操作台松了口气，“小霞、小刚，这个训练室是设定成一旦启动开关，三秒关门，设定好的时间结束以前是不会停下的！”
“不是吧？！”小霞、小刚有种希望落空的感觉。
“不过你们放心，你们这是最低档次的，时间也设定在最短时间！”
“最低档次！”
“那时间是多少！？”小智的话让小霞、小刚再次燃起了希望。
“‘一小时’，你们还剩‘十五分钟’！”
“一小时！十五分钟！”小霞、小刚这下彻底绝望了。
“放心吧，我做过测试，保证一小时内，‘绝对不会死’！”
“你是拿谁做测试的！？”×2
小智卖了个萌的说道：“我啊~”
“你根本就不能算是人！！”×2
“放心我会等你们出来的。”小智想起以前第一次和皮卡丘进去的时候也是这样的，还有球队的队员们。有点怀念在球队的时候，球队现在在其它地方比赛。小智有空会在电视看他们的比赛。
“好冷！好烫！……”小霞、小刚这次是在一座天平跳来跳去，因为一边冷一边热。小智一手抱着波克比在大门口和皮卡丘下棋（下什么棋请自猜），“小霞那边有安全的地方！”小刚发现了一块空地，看起来很安全，于是他们用尽力气跳了过去。
“呼呼~~终于安全了。”小霞和小刚四肢撑着地面拼命喘气。
“嗤嗤！”地突然伸出几个加特林一样的发射器，“不会吧……”
小智突然想起一件事，使他一时落不了子。“唔啊啊啊啊！！”小智刚准备出声，可已经晚了。小霞和小刚已经中机关了。
正当小霞和小刚以为已经可以安心的时候，又中了一个新的训练装置，地突然伸出的几个加特林一样的发射器对着他们疯狂发射足球炮弹，那是一阵扫射。小智听到小霞和小刚的惨叫时就已经知道了。那是门将（守门员）专用的，也可以说是小智专用的，所以是“最难”的。现在小智和皮卡丘也只能保持沉默，为他们祈祷继续下棋。
时间一分一秒的过去，小刚跟小霞的惨叫声也越来越弱，小智和皮卡丘的棋也快下完了。训练时间终于结束了，在放下最后一颗棋子（谁胜谁负请自猜）的时候大门打开小霞和小刚全身脏兮兮的倒在了地。
“你们还好吗？”
“皮卡~皮~”
“……………………”小霞、小刚两人趴在地烧蚊香了。
小智与皮卡丘立刻去查看两人的情况，还好只是累晕了而已。小智把两人带回屋里（用拖的）休息，和宝可梦们打扫完地下仓库的训练室，和宝可梦一起开始了不同档次和时间的训练。
“我当时为什么不把电闸关了？那不就停下了。等等，那不是开不了门了吗！看来下次得做个即使电闸关闭也可以开门的装置按钮（内外都要）。”
…………“求鲜花”…………