小智和皮卡丘来到港口，这里停泊着一艘豪华的邮轮，出现了两个怪人送给他们参加船举行的宝可梦训练家派对的招待券，小智没有多想，决定去玩。他也不知道为什么觉得船会发生什么。
小智不想回忆剧情，想顺其自然，除非是不得了的大事和实在想不出解决方法的事。才会去想剧情，可有时候不管这么想都想不起来就算是特殊或是重要剧情也想不起来，不过有时会突然想起一些剧情，但却是很快就要发生的一点点剧情。但他不在意，要是知道以后的事不就没意识了吗？
小智和皮卡丘寻找了一番后终于来到了圣安奴号，里面非常豪华，有个资格一样的训练家和店铺还有美食。
“皮卡丘，我们去好好玩玩！”
“皮卡~”
“好耶，打…好耶。”正在小智和皮卡丘参观的时候一阵欢呼，引起了他们的注意。原来是有人在对战。
“拉达，用你的愤怒门牙攻击。”一只拉达咬碎了宝石海星的宝石。这时一个胜利的灯在一个绅士头闪了起来。
“你不要紧吧，宝石海星。”它的训练家担心的抱住它。
“这只是小小的模拟战罢了，这能说是胜利女神对我比较偏心吧。”绅士对宝石海星的训练家说道。
“你好强哦。”一个穿着礼服的女士走过来抱住哪位绅士，看起来好像是恋人或是妻子。
“谢谢你，玛德麦洁儿。你应该把你的宝石海星锻炼得强一点吧。”绅士向女士打了个招呼后指着了宝石海星的训练家，又说：“还有没有谁有这个勇气，向我的拉达挑战的呢？”
“我来当你的对手。”小智走出来说道。
结果才打了一会，绅士就抱起拉达说：“到此为止，算是平手了。”就走了。
小智撑了撑肩想算了，继续和皮卡丘逛店铺，这时他看到小次郎被一位鱼市的老板欺骗，花大价钱买了一条除了跃起以外什么本事都没有的鲤鱼王。小智突然有一种不安感，但他希望是他想太多了，和皮卡丘他们在餐厅大吃起来。
“嗨，在这里玩得愉快吗？”刚才的绅士和女士走了过来，说想和小智“交换宝可梦”。小智当然是拒绝了他（大家早就已经是家人了）。
正在小智和皮卡丘他们在游玩时，突然游轮的工作人员都摇身变成了火箭队。门突然关了起来，灯也关了。
“……（火箭队开场白）”小次郎好像没精神。
“所有在这里的宝可梦，我们火箭队通通都要拿走。”武藏说完就和其他火箭队成员用他们的机器吸走训练家的精灵球，吸不走的就明强。
有一个火箭队员走到小智后面，刚把脸凑过来说一句“快交出精灵球。”就被小智打飞，砸在墙。小智说道：“与其让你们夺走宝可梦，还不如战斗到底。大家一起打败他们！夺回精灵球！”
“好，赞成！战斗…”被小智鼓舞后，小智带着众人一起拿出宝可梦开始反击。
火箭队也派出宝可梦战斗，在漫长的战斗，最终是训练家们获胜，抓住了所有火箭队成员除了武藏、小次郎和喵喵，抢回了所有精灵球。这时船突然剧烈摇晃起来。
“是暴风雨！”于是众人赶紧逃到救生艇。
正在小智收回宝可梦，想带着皮卡丘逃的时候想到了火箭队。虽然他们是坏人，但也不能见死不救。于是小智带着皮卡丘把被绳子绑着的火箭队们拖到剩下的救生艇（后来被君莎小姐带走了）。
“杰尼龟，拜托你了。”小智叫出杰尼龟，和皮卡丘一起逃了出去。
武藏、小次郎、喵喵也靠鲤鱼王逃走了，他们之后的遭遇和之后的剧情一样。